В конце 2018 года швейцарская компания Roche наладила доставку образцов тканей онкологических больных из России в лабораторию в Германии, где проводятся молекулярно-генетические исследования по современной технологии NGS.
В этой статье мы расскажем о том, как в раковых клетках обнаруживают мутации с применением метода NGS, как результаты этого анализа могут повлиять на эффективность лечения, и кому необходимо данное исследование.
Интеллектуальная собственность https://www.euroonco.ru
Каждый рак уникален
Еще совсем недавно злокачественные опухоли классифицировали только по гистологическому принципу, то есть в зависимости от того, в каком органе они возникали, и как опухолевая ткань выглядела под микроскопом.
С развитием молекулярной биологии и генетики, ученые смогли заглянуть глубже. Изучены многие мутации, приводящие к раку, «неправильные» молекулы, благодаря которым опухоль бесконтрольно растет, поддерживает свою жизнедеятельность, защищается от иммунной системы. Заблокировать эти молекулы и тем самым затормозить прогрессирование заболевания помогают современные таргетные препараты, иммунопрепараты.
Сложность в том, что не существует двух злокачественных опухолей с одинаковыми молекулярно-генетическими характеристиками. Набор мутаций всегда разный, поэтому универсальной «таблетки от рака» нет и быть не может. Для того чтобы назначить эффективное лечение, врач должен понимать, какие мутации есть в опухолевых клетках у конкретного пациента, присутствуют ли в них «мишени» для того или иного препарата.
Для этого и нужны молекулярно-генетические анализы.
Некоторые из генов, связанных с развитием рака, хорошо изучены и постоянно на слуху. Например это мутации EGFR при раке легких, HER2, BRCA1 и BRCA2 при раке молочной железы, BRAF при меланоме.
Американская компания Foundation Medicine, Inc. (Кембридж, США) проводит комплексное генетическое профилирование, во время которого изучают все известные мутации четырех разных классов более чем в 300 генах. Это помогает составить максимально полный «молекулярный портрет» злокачественной опухоли и выбрать наилучшую схему лечения.
Мы в «Евроонко» поддерживаем это начинание и считаем его важным шагом в развитии помощи онкологическим больным в России. Если пациенту необходим молекулярно-генетический анализ, наши врачи рассказывают о такой возможности и помогают ею воспользоваться.
Технология нового поколения
Foundation Medicine, Inc. применяет технологию секвенирования нового поколения (англ. next generation sequencing, сокращенно NGS). С ее появлением изучение последовательности всей ДНК человека стало возможным за один день. Методам «первого поколения» для этого требовалось около десяти лет. Технология NGS вывела молекулярную биологию на новый уровень и открыла большие возможности для персонализированной медицины.
С помощью NGS изучают все известные мутации четырех видов:
1. Замена оснований. При этом меняется одна из «букв» генетического кода, что приводит к нарушению структуры белка, кодируемого данным геном.
2. Делеции – утрата определенного участка хромосомы.
Инсерции – когда в гене возникает «лишняя» вставка другой ДНК.
3. Изменение числа генов – увеличение или уменьшение числа копий определенного гена, в результате чего снижается или повышается его экспрессия (активность).
4. Фьюжн – слияние генов, когда из двух отдельных образуется один гибридный.
Кроме того, NGS помогает выявить микросателлитную нестабильность, мутационную нагрузку – количество мутаций на определенный объем генома клеток опухолей.
По завершении анализа врач получает максимально полную информацию о состоянии генов злокачественной опухоли, и эти данные помогают:
- Выявить мутации, которые могут повлиять на эффективность лечения, прогноз для пациента.
- Подобрать оптимальные схемы терапии.
- Узнать, в каких клинических испытаниях может принять участие пациент, если ему не помогают доступные виды лечения.
Услуги FMI
В настоящее время FMI предлагает три вида анализов:
- FoundationOne CDx – для солидных (плотных) опухолей. Именно этот анализ применяется в большинстве случаев. Врач проводит биопсию – получает фрагмент опухоли и отправляет в лабораторию. В среднем через 2 недели из лаборатории приходит отчет. Анализируются все рекомендованные гены при солидных опухолях. Исследование микросателлитной нестабильности и мутационной нагрузки помогает в принятии решений по поводу проведения иммунотерапии. Тест FoundationOne CDx одобрен американским Управлением по контролю качества лекарственных препаратов и продуктов питания (FDA), он регулярно обновляется в соответствии с текущими рекомендациями.
- FoundationOne Heme – для сарком (злокачественных опухолей соединительной ткани) и злокачественных заболеваний кроветворной системы (лимфом, лейкозов и др.).
- FoundationOne Liquid – анализ ДНК опухолевых клеток, свободно циркулирующей в крови. Это наиболее современная технология, так называемая жидкостная биопсия. Для того чтобы провести такой анализ, нужны две пробирки с кровью по 8,5 мл.
Кому необходимо такое исследование?
Тест FoundationOne CDx, как правило, показан на поздних стадиях рака, когда нужно подобрать эффективные таргетные препараты, иммунопрепараты. Тесты FoundationOne Heme могут быть использованы для диагностики заболевания, оценки прогноза, выбора подходящего лечения.
Чаще всего анализ FoundationOne CDx применяют при следующих типах рака:
- Немелкоклеточный рак легкого: мутации EGFR, ALK, BRAF.
- Меланома: мутации BRAF.
- Рак молочной железы: мутация HER2.
- Колоректальный рак: мутация KRAS.
- Рак яичников: мутации BRCA1, BRCA2.
Для лечения опухолей с такими мутациями существуют зарегистрированные таргетные препараты. Но этими пунктами список не ограничивается. Решение о необходимости исследования должен принимать лечащий врач в каждом случае индивидуально.
Какую информацию предоставляет лаборатория по результатам анализа?
Отчет состоит из трех частей. В первой части указаны все мутации, обнаруженные в опухоли у данного пациента, и таргетные препараты, которые будут наиболее эффективны в данном случае:
- Таргетная терапия, одобренная для данного типа опухолей с обнаруженными мутациями.
- Таргетная терапия, которая одобрена для лечения других типов рака с аналогичными мутациями.
- Список клинических исследований, которые могут иметь значение в случае с данным пациентом.
Во второй части отчета представлен литературный обзор с подробными данными об уровне значимости, частоте встречаемости, действии на течение заболевания и возможности использовать тот или иной вид таргетной терапии при выявленных генетических нарушениях. Эта информация регулярно обновляется.
В третьей части отчета указаны клинические исследования, в которых пациент может принять участие.
Анализы FNI уже хорошо себя зарекомендовали на бесплатных образцах по 50 пациентам с раком молочной железы, толстой и прямой кишки, пищевода, желудка, яичников. После тестирования, проведенного компанией Roche, некоторые пациенты, которым не удавалось подобрать таргетные препараты с помощью других методов диагностики, ответили на терапию, составленную в соответствии с рекомендациями лаборатории.
В клиниках «Евроонко» доступны наиболее современные методы диагностики и оригинальные противоопухолевые препараты последнего поколения. Мы знаем, как помочь при запущенном раке, если лечение, назначенное другим врачом, перестало помогать. Свяжитесь с нами.
