Потери и приобретения в хромосомах раковых клеток: новые способы их обнаружения | Клиники «Евроонко»

Потери и приобретения в хромосомах раковых клеток: новые способы их обнаружения

115191, Москва, Духовской переулок, 22Б
350015, Краснодар, Северная ул, 315
198035, Санкт-Петербург, Межевой канал, д.4, лит.А
603155, Нижний Новгород, Большая Печёрская ул., д.26
Новые-способы-обнаружения-делеций-и-дупликаций

Ключевую роль в диагностике и лечении онкологических заболеваний играет знание о мутациях, происходящих в раковых клетках. Современные технологии секвенирования ДНК помогают обнаружить многие из этих генетических нарушений, но, к сожалению, не все. Новый алгоритм, разработанный специалистами в области компьютерных технологий, помогает с более высокой точностью идентифицировать утраты (делеции) и увеличение числа копий (дупликации) участков хромосом при злокачественных опухолях.

Ожидается, что эта технология поможет получить ценные знания об эволюции злокачественных новообразований в процессе прогрессирования заболевания и распространении раковых клеток в организме.

Известно, что выпадения и дупликации участков хромосом возникают при большинстве злокачественных опухолей, таких как рак яичников, молочной железы, поджелудочной железы и простаты. Эти нарушения бывают разных масштабов, они могут вовлекать как отдельные гены, так и все 23 пары хромосом. В итоге активируются гены, которые способствуют развитию рака (онкогены), или становятся неактивными гены, подавляющие опухолевый рост.

Профессор Бен Рафаэль (Ben Raphael), соавтор исследования, отмечает:

Они [дефектные гены] сами по себе являются движущей силой в развитии онкологических заболеваний, а также взаимодействуют с другими мутациями в раковых клетках.

Технология секвенирования ДНК — эффективный метод обнаружения мутаций в опухолевых клетках, но с помощью неё невозможно «прочитать» хромосому от начала до конца. Секвенирование работает немного по-другому: с помощью него исследуют фрагменты хромосом, а потом упорядочивают их, и это помогает составить целостную картину. При этом сложно обнаружить «пробелы» в цепочке ДНК или повторяющиеся участки.

Для решения этой проблемы учёные создали математические алгоритмы, которые позволяют осуществлять поиск среди множества фрагментов ДНК и определять делеции и дупликации.

Эти алгоритмы были названы HATCHet и CHISEL, они подробно описаны в публикациях в научных журналах Nature Communications и Nature Biotechnology.

Симон Захария (Simone Zaccaria), соавтор исследования, объясняет:

Все клетки, геном которых мы секвенируем, являются продуктом одного и того же эволюционного процесса. Благодаря этому, последовательности можно объединить таким образом, чтобы получить общую картину. Реальность такова, что современные технологии секвенирования ДНК имеют определённые ограничения, и преодолеть их помогают математические модели. В дальнейшем эти методики будут совершенствоваться параллельно.

С появлением технологии секвенирования нового поколения (next-generation Sequencing, NGS) для биологов и врачей открылась масса новых возможностей. Например, если онкологическому пациенту при раке в запущенной стадии перестали помогать все препараты, доступные в рамках современных протоколов, с помощью NGS можно «просканировать» гены его опухолевых клеток, обнаружить мутации и персонально подобрать препараты, которые могли бы помочь. Европейская клиника сотрудничает с ведущими мировыми лабораториями, и у нас есть возможность выполнять такие анализы.

Источник: sciencedaily.com.

Запись на консультацию круглосуточно
+7 (495) 151-14-53+7 (861) 238-70-54+7 (812) 604-77-928 800 100 14 98

Подпишитесь на рассылку «Евроонко»
и будьте в курсе новостей
и событий клиники
Нажимая на кнопку, я подтверждаю согласие на обработку персональных данных

Лечение пациентов проводится в соответствии со стандартами и рекомендациями наиболее авторитетных онкологических сообществ. «Евроонко» является партнёром Фонда борьбы с раком. ВНИМАНИЮ ПАЦИЕНТОВ: Рекомендации по лечению даются только после консультации у специалиста. Ваши персональные данные обрабатываются на сайте в целях его корректного функционирования. Если вы не согласны с обработкой ваших персональных данных, просим вас покинуть сайт. Оставаясь на сайте, вы даёте согласие на обработку ваших персональных данных.

1 2

Политика конфиденциальности © ООО «Центр инновационных медицинских технологий». 2012 - 2021
Товарный знак зарегистрирован. Все права защищены. Незаконное использование преследуется по закону.

1 2 3 4
Содержание данного интернет ресурса (сайт https://www.euroonco.ru/), включая любую информацию и результаты интеллектуальной деятельности, защищены законодательством Российской Федерации и международными соглашениями. Любое использование, копирование, воспроизведение или распространение любой размещенной информации, материалов и (или) их частей не допускается без предварительного получения согласия правообладателя и влечет применение мер ответственности.
Сведения и материалы, размещенные на сайте , подготовлены исключительно в информационных целях и не являются медицинской консультацией или заключением. Авторы информационных материалов сайта не могут гарантировать применимость такой информации для целей третьих лиц и не несут ответственности за решения третьих лиц и связанные с ними возможные прямые или косвенные потери и/или ущерб, возникшие в результате использования информации или какой-либо ее части, содержащейся на сайте.

Сайт использует файлы cookies для правильного функционирования, индивидуального подбора контента в социальных сетях и сбора анонимной статистики о пользователях с помощью систем аналитики для повышения удобства использования. Оставаясь на сайте, вы соглашаетесь с правилами использования файлов cookies.

Принять и закрыть

Нажимая на кнопку "Отправить", я даю согласие на обработку персональных данных

Нажимая на кнопку "Отправить", я даю согласие на обработку персональных данных

Ваш регион

Москва Выбрать другойДа, всё верно

Выберите город

  • Москва
  • Санкт-Петербург
  • Краснодар
  • Нижний Новгород
  • Самара
8 (495) 106-26-38 8 (812) 604-75-19 8 (861) 238-70-66 +7 (812) 604-34-46 +7 (812) 606-73-49 +7 (812) 612-01-65
Как доехать