Геймеры помогут в изучении рака

27 января 2022 года ученые из Барселоны запустили видеоигру под названием GENIGMA. В ней каждый желающий может решать головоломки и тем самым генерировать данные, которые необходимы для исследования генов раковых клеток. Это поможет лучше изучить рак молочной железы и понять, как с ним бороться.

Новая игра доступна на мобильных устройствах на операционных системах iOS и Android. В ней можно выбрать английский, испанский, каталанский или итальянский язык. Это приложение стало результатом научного проекта, над которым в течение двух с половиной лет работали специалисты из Центра геномной регуляции (CRG), Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG) и профессионалы в области разработки компьютерных игр.

GENIGMA была создана для того, чтобы ускорить ход исследований в области изучения линий раковых клеток. В настоящее время в этой сфере не хватает знаний, отсутствуют подробные справочные «карты генома». Из-за этого ученым сложно определять точное месторасположение генов, которые представляют интерес в качестве терапевтических мишеней, и участки ДНК, в которых возникают потенциальные мутации.

Профессор Марк А. Марти-Реном (Marc A. Marti-Renom), работы которого легли в основу GENIGMA, рассказывает:

Исследование клеточных линий играет важную роль в создании вакцин, новых противоопухолевых препаратов, совершенствовании методов ЭКО при бесплодии. Это один из важных столпов современной биологии. Однако, отсутствие подробных карт геномов тормозит научный прогресс. Это то же самое, что отправить человека в незнакомый город и снабдить картой, составленной несколько столетий назад. Мы можем обновить наши «карты», привлекая к этому различных людей. Для этого и запущена игра GENIGMA, она поможет нам ускорить прогресс в исследовании рака молочной железы.

Ученые под руководством Марка А. Марти-Ренома разработали методы создания справочных карт генома путем его визуализации в трехмерном пространстве. Однако, чтобы заставить искусственный интеллект разобраться в этих данных, потребовалось бы очень много времени и огромные вычислительные мощности.

Исследователи посчитали, что генерация данных геймерами могла бы быть намного эффективнее. Эта идея и положила начало проекту GENIGMA. В отличие от ИИ, «коллективный интеллект» множества игроков сможет добывать нужные данные не только быстро, но и применяя творческий подход, что тоже немаловажно.

Интеллектуальная собственность https://www.euroonco.ru

Что собой представляет игра GENIGMA?

В приложении игрокам предлагается решить головоломку, состоящую из блоков разных цветов и форм. В реальности же каждая строка с такими последовательностями представляет собой определенную генетическую последовательность в раковых клетках. То, каким образом игроки группируют блоки, потенциально может помочь понять, как расположены гены.

Игрок должен расположить блоки таким образом, чтобы набрать максимальное количество очков. Чем больше игроков и чем больше у них очков, тем выше вероятность того, что ученые смогут найти правильную последовательность на определенной части генетической карты.

Элизабетта Броглио (Elisabetta Broglio), один из соавторов проекта, отмечает:

Любой человек из любой точки мира, у которого есть смартфон, может скачать GENIGMA и внести свой вклад в развитие науки, применив для этого свою ловкость и логическое мышление. GENIGMA будет анализировать решения, которые игроки предлагают как единый большой коллектив, а не как отдельные лица. Таким образом, получится найти творческие решения, которые были бы невозможны при использовании детерминированных компьютерных алгоритмов.

Для начала исследователи решили составить карту генома клеточной линии T-47D при раке молочной железы. Она очень часто используется для исследования злокачественных опухолей. Нужно составить эталонную карту, включающую 20 тысяч генов. Исследователи считают, что это смогут сделать 30 тысяч игроков, если каждый решит по 50 головоломок.

Компания рассчитана на 3 месяца. В течение этого времени каждый понедельник GENIGMA будет представлять новые фрагменты генома клеточной линии T-47D, а игроки станут эти фрагменты упорядочивать. Первые фрагменты генома, которые необходимо разложить по полочкам, относятся к хромосоме № 17. Она содержит множество участков, мутации в которых приводят к развитию рака молочной железы. Здесь же находится и знаменитый ген BRCA1, поломки в котором связаны с 40% случаев наследственного рака груди.

Игру GENIGMA разрабатывали 50 человек в 13 мастерских в течение двух с половиной лет. Ее протестировали сами ученые, студенты, школьные педагоги, медицинские работники, специалисты по биоэтике, журналисты, представители пациентских сообществ, разработчики игр и др.

Координатор команды разработчиков игр Ориол Риполл (Oriol Ripoll) отмечает:

Возможность взять в руки телефон и поиграть в GENIGMA очень увлекательна, потому что большинство людей не имеет отношения к науке и не понимает, что происходит в застенках лабораторий. Такие игры помогают не только увлекательно провести время, но и больше узнать о научных исследованиях, принять в них непосредственное участие.

Современная наука во многом опирается на получение и анализ больших массивов данных. В онкологии это помогает разбираться в геноме и других характеристиках раковых клеток, понять, как с ними бороться, создать новые эффективные препараты. В клиниках «Евроонко» применяются все достижения современной медицины, новейшие разработки, которые помогают в лечении рака молочной железы и других злокачественных опухолей. У нас всегда есть в наличии все зарегистрированные в России оригинальные препараты с доказанной эффективностью, и мы немедленного готовы приступить к лечению.

Источник: sciencedaily.com.